esta es una guía sencilla de como solucionar este problema de que solo cuente las horas jugadas o funcione el menu de steam en el launcher y no en el juego mismo.

paso 1 hacer click derecho en el juego

paso 2 ir a archivos locales y encortar la aplicación llamada fallout 3, hacer click derecho y darle click a copiar como ruta de acceso

paso 3 ir a propiedades y pegar lo copiado en opciones de lanzamiento, y tambien poner %command% para que funcione

te tendría que dar algo así en opciones de lanzamiento:

"C:\Program Files (x86)\Steam\steamapps\common\Fallout 3 goty\Fallout3.exe" %command%

esto hará que abra directamente el juego sin tener que pasar por el launcher, por lo que ahora te contara las horas jugadas y el menu de steam tendria que funcionar correctamente