Когда Хаосова ересь, мутации или проникновение ксеносов целиком охватывает планету и очищение планеты невозможно никаким другим способом, ей, вероятно, надлежит Экстерминатус — поражение планетологической системы, не совместимое с выживанием повстанцев, грибных спор орков, личинок тиранидов или чего подобного. Уничтожение всего населения осуществляется для того, чтобы предотвратить любую возможность распространения заражения.

Экстерминатус это крайняя, но, в общем, штатная мера, которая применяется, когда полное уничтожение считается лучшим решением, чем традиционные методы борьбы с ересью. Мир, возможно, полностью перешел на сторону Хаоса, или его правительство было свергнуто и заменено ксеносами — например, такими, как генокрады. Или это может быть неимперский мир, на котором живет особо опасная раса ксеносов. Экстерминатус применяют, когда мир недостаточно ценен по сравнению с теми ресурсами, которые потребуется потратить на покорение его Человечеством.