Il BOPE è specializzato in azioni di guerriglia urbana orientate al controllo del traffico di droga nelle favelas. La droga infatti rappresenta il cardine dell'economia di queste baraccopoli degradate. Gli ufficiali del BOPE sono specializzati in:

distruzione delle barricate erette dai trafficanti per impedire l'accesso della polizia;
recupero di poliziotti o civili rimasti feriti in scontri nelle favelas;
consegnare mandati di arresto ad alto rischio;
recupero di ostaggi;
soppressione di rivolte all'interno delle prigioni;
missioni speciali in territori paludosi e montani;